Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms