Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms