Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms