Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms