Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
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GAPVD1Q14C86 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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