Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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