Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms