Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms