Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTMAP06454 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTMAP06454 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTMAP06454 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTMAP06454 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTMAP06454 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTMAP06454 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTMAP06454 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTMAP06454 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms