Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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