Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms