Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN6Q9Y6Q1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN6Q9Y6Q1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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