Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP16Q9Y5T5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms