Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2J1Q9Y385 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.8 ms