Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX24Q9Y343 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX24Q9Y343 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms