Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC5Q9UQL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms