Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms