Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDZRN3Q9UPQ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms