Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC12A4Q9UP95 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC12A4Q9UP95 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4Q9UP95 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms