Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH7Q9ULB5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms