Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL25

RAB21, Ras-related protein Rab-21, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB21Q9UL25 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB21Q9UL25 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB21Q9UL25 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms