Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms