Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC2Q9UKJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHIC2Q9UKJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms