Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms