Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms