Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-18Q9QC07 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-18Q9QC07 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-18Q9QC07 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-18Q9QC07 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-18Q9QC07 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-18Q9QC07 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-18Q9QC07 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-18Q9QC07 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-18Q9QC07 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms