Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMC3IPQ9P2W1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms