Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms