Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS1Q9NYS0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKIRAS1Q9NYS0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms