Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNK4Q9NYG8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms