Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM248Q9NWD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms