Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT84Q9NSB2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms