Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SH2B1Q9NRF2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SH2B1Q9NRF2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms