Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM8Q9NQV8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms