Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms