Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR55Q9H6Y2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms