Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RWDD1Q9H446 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RWDD1Q9H446 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms