Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC68Q9H2F9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms