Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX5Q9H2C1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX5Q9H2C1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX5Q9H2C1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX5Q9H2C1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX5Q9H2C1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX5Q9H2C1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX5Q9H2C1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX5Q9H2C1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms