Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EHD4Q9H223 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms