Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRTNQ9H040 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms