Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRINP2Q9C0B6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP2Q9C0B6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP2Q9C0B6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP2Q9C0B6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP2Q9C0B6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms