Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM7Q9C029 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms