Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms