Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM31Q9BZY9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms