Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTPBP4Q9BZE4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms