Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms