Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5DQ9BY66 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5DQ9BY66 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms