Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms