Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM208Q9BTX3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM208Q9BTX3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM208Q9BTX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM208Q9BTX3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM208Q9BTX3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms